Ζητήματα διαφάνειας και λανθασμένων χειρισμών εντοπίζει η Ελεγκτική Υπηρεσία σε σχέση με το έργο του Ψηφιακού Πολίτη, αφού από την έρευνα που διενεργήθηκε εκφράζεται ο προβληματισμός ότι η διαδικασία της απευθείας ανάθεσης στον ανάαδοχο ενδεχομένως να μην υπηρετεί πλήρως τις Αρχές της διαφάνειας και της ισής μεταχείρισης οικονομικών φορέων.
Από τα ευρήματα της Ελεγκτικής, διαπιστώνεται επίσης πως στην προκειμένη περίπτωση, η βέλτιστη πρακτική θα ήταν η επιλογή ανάθεσης της κοινής εφαρμογής
