Έγραψαν την δική τους ιστορία και μαζί πανηγύρισαν μαζί το κύπελλο του 2001 με αντίπαλο στον τελικό, τη Νέα Σαλαμίνα. Οι τρεις της φωτό, Χρίστος Γερμανός, Φίλιππος Φιλίππου και Σίνισα Ντομπρασίνοβιτς ξεκίνησαν βασικοί, με προπονητή τον Ανδρέα Μουσκάλη. Ο Απόλλωνας με γκολ του Ζουμπάρεφ στο 66’ νίκησε 1-0 τη Νέα Σαλαμίνα και κατέκτησε το τρόπαιο.
Ο τελικός έγινε στις 12.05.2001 στο Στάδιο ΓΣΠ στην παρουσία 15 χιλιάδων θεατων και διαιτήτευσε
